A globalização do comércio de alimentos tem exigido sistemas robustos de rastreabilidade para garantir a segurança do consumidor, a qualidade dos produtos e a sustentabilidade. Ao promover a transparência nas práticas agrícolas e encorajar o uso responsável dos recursos, a rastreabilidade desempenha um papel importante na proteção do meio ambiente e no apoio ao desenvolvimento sustentável. Este estudo examina os efeitos comerciais das medidas não tarifárias (MNTs) relacionadas à rastreabilidade no comércio internacional, com foco na rastreabilidade de insumos e processos no setor agrícola, com análises específicas nos setores de carne, frutas e pescados. Utilizando um modelo de gravidade estrutural e estimativa de Pseudo Máxima Verossimilhança de Poisson com efeitos fixos (FE) de alta dimensão, analisamos fluxos comerciais entre 53 países exportadores e 56 países importadores, abrangendo 2.081 produtos agrícolas de 2012 a 2021. Os resultados revelam que as medidas de rastreabilidade de insumos geralmente aumentam o comércio, enquanto a rastreabilidade de processos muitas vezes impõe barreiras comerciais. A interação entre as medidas de rastreabilidade de insumos e processos apresenta efeitos positivos no setor de carne. Esses resultados ressaltam o papel diferenciado das medidas de rastreabilidade, destacando a necessidade de abordagens de políticas personalizadas que considerem as características únicas de diferentes setores e países. As descobertas enfatizam a necessidade crítica de equilibrar a facilitação do comércio com padrões rigorosos de segurança, qualidade e sustentabilidade.