O objetivo deste artigo é discutir os avanços e possíveis caminhos nos estudos sobre duas temáticas essenciais na compreensão do funcionamento da administração pública brasileira e que atualmente estão em destaque no campo das políticas públicas: governança pública e inovação. Essas agendas de pesquisa, nos últimos anos, estruturaram-se na Diretora de Estudos e Políticas do Estado, das Instituições e da Democracia (Diest) do Ipea em um espaço de debate e produção de conhecimento sobre políticas públicas. Elas ganham ainda mais relevância em função da necessária adequação e aplicação dos seus conceitos e teorias ao particular arcabouço político e institucional brasileiro, marcado pela singularidade na combinação de fatores como multipartidarismo, federalismo, participação social, fortalecimento das agências reguladoras, dos sistemas de justiça e de controle, entre outros. Logo, este artigo se justifica como um esforço de reflexão sobre o que já aprendemos, bem como de prospecção sobre temáticas que ainda carecem de pesquisas científicas aplicadas. Além desta introdução, o trabalho possui mais três seções. Na seção 2, desenvolve-se uma síntese dos principais achados das linhas de pesquisas de governança e inovação, desenvolvidas pela Diest nos últimos anos. Na seção 3, temas de interesse para agenda futura são abordados na perspectiva de continuidade e aprofundamento de do campo de estudo nacional. Por fim, na seção 4, são tecidas algumas considerações sobre a contribuição do artigo.